Твір має дві частини, присвяту і два прологи, у яких сформульовано ключові тези загального задуму. У "Пролозі в театрі" зображено дискусію щодо мистецтва. У "Пролозі на небесах" відбувається диспут щодо Фауста між Господом та небесним воїнством, з одного боку, та духом зла Мефістофелем, з другого. Зовні не пов'язані між собою, прологи ілюструють ідею співіснування людських та надлюдських сил у земному бутті. Основна дія трагедії – розгорнуте зображення "експерименту" з ученим, про який ідеться в другому пролозі.